MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 1272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011982	TCA	2	6	77222	77227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_011982	GTC	2	6	77257	77262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_011982	ATG	2	6	77302	77307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011982	GCTG	2	8	77335	77342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
505	NC_011982	CTT	2	6	77387	77392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_011982	AAG	2	6	77428	77433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011982	GCC	2	6	77441	77446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_011982	TTCGCT	2	12	77451	77462	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_011982	GGC	2	6	77523	77528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_011982	TCAG	2	8	77537	77544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
511	NC_011982	CAG	2	6	77575	77580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_011982	AAG	2	6	77632	77637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011982	GC	3	6	77656	77661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_011982	GCG	2	6	77666	77671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_011982	GGC	3	9	77745	77753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_011982	ATA	2	6	77792	77797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011982	GCC	2	6	77817	77822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_011982	GCG	2	6	77831	77836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_011982	CTGTG	2	10	78162	78171	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
520	NC_011982	TTG	3	9	78275	78283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011982	GAG	2	6	78287	78292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011982	GCC	2	6	78297	78302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_011982	GAA	2	6	78308	78313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011982	GTCG	2	8	78392	78399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
525	NC_011982	GCA	2	6	78419	78424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_011982	CCAC	2	8	78425	78432	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
527	NC_011982	CTG	2	6	78473	78478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_011982	AGG	2	6	78530	78535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011982	CAT	2	6	81705	81710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_011982	GTG	2	6	81737	81742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011982	CGAC	2	8	81766	81773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
532	NC_011982	TCT	2	6	81850	81855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_011982	CGG	2	6	81862	81867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011982	CGC	2	6	81868	81873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_011982	CAA	3	9	81882	81890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_011982	GCG	2	6	82344	82349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_011982	GCC	3	9	82412	82420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_011982	AAC	2	6	82771	82776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011982	CGC	2	6	83114	83119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_011982	TTG	2	6	83439	83444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011982	CAT	2	6	83832	83837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011982	CCG	2	6	83855	83860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_011982	GCG	2	6	86801	86806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_011982	GGA	2	6	86885	86890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011982	CCG	2	6	86896	86901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_011982	CGA	2	6	86945	86950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_011982	GGC	2	6	86957	86962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_011982	CGT	2	6	86974	86979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011982	CGA	2	6	86994	86999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011982	CGATGG	2	12	90863	90874	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
551	NC_011982	CTG	2	6	90903	90908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_011982	GCG	2	6	90946	90951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_011982	CTT	2	6	90957	90962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_011982	CGG	2	6	91033	91038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011982	GCC	2	6	91092	91097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_011982	TCT	2	6	91112	91117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_011982	TCG	2	6	91175	91180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_011982	GCG	2	6	91215	91220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_011982	GCC	2	6	91262	91267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_011982	GGATGG	2	12	91323	91334	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011982	CGGC	2	8	91354	91361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_011982	GAC	2	6	91373	91378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_011982	GGCC	2	8	91387	91394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_011982	CCG	2	6	91429	91434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_011982	CAG	2	6	91485	91490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_011982	AC	3	6	91576	91581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_011982	TGC	2	6	91591	91596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_011982	GC	3	6	91603	91608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_011982	TGG	2	6	91723	91728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011982	GCG	2	6	91824	91829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_011982	AGC	2	6	91902	91907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_011982	TGC	2	6	91935	91940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_011982	TCG	2	6	91956	91961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_011982	TGG	2	6	91976	91981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011982	TCG	2	6	91998	92003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_011982	CGT	2	6	92053	92058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_011982	GCTG	2	8	92781	92788	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
578	NC_011982	ATT	2	6	92807	92812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011982	CAC	2	6	92831	92836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_011982	GGA	2	6	92857	92862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011982	CAGG	2	8	93339	93346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
582	NC_011982	GCG	2	6	93994	93999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_011982	ACCA	2	8	94101	94108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_011982	GTC	2	6	94493	94498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_011982	TTCA	2	8	94544	94551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_011982	TCG	2	6	94711	94716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_011982	TTC	2	6	94796	94801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_011982	CGTGA	2	10	94815	94824	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
589	NC_011982	CCAA	2	8	95528	95535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_011982	GTC	2	6	95586	95591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_011982	GTT	2	6	95621	95626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011982	T	6	6	95648	95653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011982	AAC	2	6	95657	95662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_011982	GCC	2	6	95674	95679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_011982	GTC	2	6	95723	95728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_011982	GTC	2	6	95758	95763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011982	T	6	6	95771	95776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011982	GTCT	2	8	95809	95816	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
599	NC_011982	TCG	2	6	96824	96829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_011982	GATT	2	8	96848	96855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011982	GGA	2	6	96898	96903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011982	GCA	2	6	97392	97397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_011982	TTC	2	6	97460	97465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_011982	ATC	2	6	97528	97533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_011982	CAT	2	6	97566	97571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_011982	TCT	2	6	97631	97636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_011982	GGT	2	6	97727	97732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011982	TTC	2	6	98637	98642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011982	CCAG	2	8	98724	98731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
610	NC_011982	GGC	2	6	99925	99930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_011982	TCG	2	6	100043	100048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_011982	TCG	2	6	100064	100069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_011982	GAC	2	6	100098	100103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_011982	TGC	2	6	100106	100111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_011982	TCA	2	6	100154	100159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011982	ACA	2	6	100253	100258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_011982	GAA	2	6	102863	102868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011982	GCT	2	6	104297	104302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_011982	AAT	2	6	104363	104368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011982	GCTGC	2	10	104477	104486	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
621	NC_011982	CTC	2	6	104572	104577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_011982	GA	3	6	104611	104616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011982	GTC	2	6	104620	104625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_011982	GAA	2	6	104670	104675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011982	ACTT	2	8	104775	104782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
626	NC_011982	AC	3	6	106463	106468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_011982	A	6	6	106471	106476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011982	G	7	7	108771	108777	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011982	CTG	2	6	108797	108802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_011982	ACA	2	6	108812	108817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_011982	GCC	2	6	110386	110391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_011982	GGC	2	6	110460	110465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_011982	GTT	2	6	110484	110489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011982	T	7	7	110488	110494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011982	TC	3	6	110536	110541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_011982	ATA	2	6	110587	110592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011982	ATA	2	6	110608	110613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011982	CAA	2	6	110666	110671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_011982	ACG	2	6	110806	110811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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772	NC_011982	A	6	6	141284	141289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_011982	TCAT	2	8	141331	141338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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